اهداف مرکز:

1) پژوهش و تحقیقات در سطوح Basic، اپیدمیولوژیک و بالینی و ایجاد الگوی منظم پژوهش پزشکی به منظور بازنگری سرویس های ارائه خدمات حل مسایل و مشکلات بیماران و ارتباط با سایر  مراکز علمی و تحقیقاتی، محققان، اساتید و دانشمندان در ایران و خارج از ایران

2) تشویق محققان منطقه و ارائه مشاوره و کمک به دانشجویان پزشکی و گروه های وابسته و سایر محققان برای طراحی پروژه های تحقیقاتی، بررسی پروپوزالهای رسیده و کمک به اجرای آنها

3) تربیت نیروی انسانی محقق از طریق آموزش

4) برقراری ارتباط رسمی و علمی با مراکز تحقیقات بیماریهای گوارش و کبد در سطح کشور، خارج کشور و سازمانهای بین المللی

5) کمک به انتشار و چاپ نتایج تحقیقات مرتبط با بیماریهای گوارش و کبد، در قالب مقاله، خلاصه مقالات، فصلنامه و برگزاری کنگره های کشوری و منطقه ای

6) رسیدن به استاندارد های آموزشی نوین از مبنایی ترین سطوح آموزش جهت بیماران، خانواده های آنها و کلیه افراد جامعه به منظور دستیابی به بینش کافی در آنان تا سطوح بالاتر آموزش جهت دانشجویان پزشکی و سایر و گروه های وابسته، دستیاران، فارغ­التحصیلان طب عمومی و متخصصان

7) هدفمندسازی تحقیقات در زمینه گوارش و کبد به صورت کاربردی نمودن آنها و بهره مندی از نتایج آن در جهت مشکلات جامعه و تامین سلامت مردم

8) ارتباط با سایر مراکز تحقیقات گوارش و کبد داخل و خارج کشور

9) توانمندسازی محققان در زمینه بیماریهای گوارش و کبد با برپایی کارگاه ها در این زمینه با محوریت آمار و روش تحقیق

10) تعیین اولویتهای منطقه در زمینه بیماریهای گوارش و کبد و جهت دهی طرحهای تحقیقاتی گوارش براساس اولویتهای به دست آمده

11) برنامه ریزی جهت اعزام محققان به کنگره های داخلی و خارجی و ارزیابی نتایج اعزام اعضا برای بهبود و ارتقا طرحهای تحقیقاتی

12) راه اندازی آزمایشگاهی با کادر مجرب جهت اعتماد به نتایج آزمایشات انجام شده

13) ارتقاء سطح علمی در فارغ التحصیلان طب عمومی و متخصصین داخلی و سایر گروه های وابسته پزشکی و پیراپزشکی

14) پیگیری کاربرد نتایج انجام شده در زمینه بیماریهای گوارش و کبد